负责农业行业质量振兴、安全生产工作。组织实施农产品质量安全监督管理有关工作。指导农产品质量安全监管体系、检验检测体系和信用体系建设。承担农产品质量安全标准、监测、追溯、风险评估等相关工作。承担肥料有关监督管理及农药生产、经营和质量监督管理工作。负责无公害农产品、绿色食品、有机食品和地理标志认证及监督监测工作。

组织实施农作物种质资源、畜禽种业、畜禽遗传资源保护和管理。负责保护中华蜜蜂华中类型物种及蜜粉源植物，监察保护区内蜂群纯度，科学育种，保护蜂群扩繁和蜜蜂资源。监督管理农作物种子、种苗。组织抗灾救灾和救灾备荒种子的储备、调拨。

承担农业植物新品种保护工作。负责外来物种管理、农业生物物种资源保护和管理工作。监督管理农业转基因生物安全。负责全区植物检疫、农作物重大病虫害防治有关工作。

起草饲料业、兽医事业、屠宰业发展政策、规划并组织实施。监督管理兽医医政、兽药及兽医器械。监督管理畜禽屠宰、饲料及其添加剂、生鲜乳生产收购环节质量安全。负责全区动物防疫检疫，承担兽用生物制品安全管理有关工作。

组织水生动植物病害防控。组织渔业水域生态环境及水生野生动植物保护。指导渔业安全生产。

起草农机作业规范和技术标准并组织实施。指导农机社会化服务体系建设，指导农业机械化技术推广应用。组织农机安全监理。组织对在用的特定种类农业机械产品进行调查。指导农机作业安全。